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著 作
1.主编 «有机波谱在新药结构确证中的应用» .辽宁科技出版社2003年7月
2.“十五”国家级规划教材《仪器分析选论》编委，科学出版社，2005.7
3.“十五”国家级规划教材《分析化学实验》编委，科学出版社，2004.9
4.研究生教学用书《现代色谱法及其在药物分析中的应用》编委，科学出版社，2005.9
论 文
1.孙秀燕等.用液相色谱-质谱联用法测定滨蒿中的茵陈色原酮.沈阳药科大学学报.2000,17(2):110-113
2.孙秀燕等.GC-MS法分析冠心苏合丸中的挥发性组分.色谱.2002.20(3)
3.孙秀燕等.GC-MS、GC法在“十滴水”制剂质量分析研究中的应用.分析试验室.2002.21(5)
4. Xiu-yan SUN ,The Detemination of Capillarisin in Artemisia Scoparia by LC/MS，International Medical Innovatory Achievement Exchange and Telemedicine Technology Symposium.，Germany 2003.1
5.孙秀燕等. GC-PCI-MS法测定中药中有机磷类农药残留量.分析测试学报.2003.22(3)
6.孙秀燕等. 新药甲磺酸帕珠沙星的有机波谱分析.分析测试学报.2003.22(6)
7.孙秀燕等. RP-HPLC法测定3种中药复方制剂中黄芩苷含量. 分析试验室.2004.23(8)
8.孙秀燕等. 姜黄挥发油抗癌活性成分研究.中草药.2005.37（7）
9.孙秀燕、李秀琴、王金辉等. 姜黄挥发油抗癌活性成分的研究. 中草药.2006.37（7）
10.孙秀燕、郑艳萍、刘志峰.温莪术环氧倍半萜类化学成分的研究. 分析测试学报.2006.25（6）
11. Xiu-yan SUN, Yan-ping ZHENG. Basic research of furanodiene extracted from essential oil of the rhizomes of Wen Ezhu. Word congress of pharmacy and pharmaceutical sciences 2007 67th congress of FIP, NS-P-058-Page 214.
12.孙秀燕，郑艳萍.姜黄油提取物乳注射液体内抗癌活性及成分分析.中国药理学通报 2008 24(7).
13.二盐酸氟哌噻吨几何异构体的核磁共振研究.（通讯作者）分析试验室.2006.25(9)
14.3个品种莪术挥发油化学成分的比较.（通讯作者）中草药.2005.36（12）
15.新药盐酸美利曲辛的有机波谱分析（通讯作者）. 分析测试学报.2007.3
16.呋喃二烯的体内外抗肿瘤作用研究（通讯作者）.烟大学报.2008, 2(21)
17.RP-HPLC法分离分析温莪术油中的六种倍半萜类成分（通讯作者）. 药物分析2008,28(7)
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