上海同济大学 生命科学与技术学院 施威扬（教授）导师简介

联系电话：021-65981839

通讯地址：

个人简介：

    1997年本科毕业于清华大学生物系，2003年在美国Washington University in St. Louis获得博士学位（发育生物学），后在University of California, Berkeley从事博士后研究，主要利用一种新的模式动物海鞘研究脊索动物早期胚胎发育的分子调控跟非编码RNA的生物学功能。

研究领域（具体内容）：

1. 脊索动物胚胎发育过程中，细胞极性化是定向运动的基础。我们的研究发现在经典的Wnt/PCP通路之外，FGF信号通路也对此起着重要的调节作用。它们通过共同控制一个下游的功能因子来决定多种细胞的机型极性化过程。我们正进一步在分子水平阐释这种调控的机制。

2. 我们利用高通量测序技术在海鞘和其它物种中发现了一种和microRNA共生的新的非编码RNA，正在进一步研究各类非编码RNA在胚胎发育跟疾病模型（前列腺癌等）中的调节作用。

3. 利用比较基因组学的方法去阐释脊索在进化过程中基因网络的组织与调控是如何变化的。我们并同时在利用这些转录组的信息，去鉴定影响人类新生儿开裂神经管这一先天发育缺陷的各种未知基因。

发表论文：(* 通讯作者)

Hendrix, D, Levine, M & Shi, W* miRTRAP, a computational approach to systematically identify miRNAs in the simple chordate Ciona intestinalis. Genome Biology 2010, 11(4):R39

Christiaen, L, Wagner, E, Shi, W & Levine, M. Emerging Model Organisms: The Sea Squirt Ciona intestinalis. Cold Spring Harbor Protocols 2009 (12)

Shi, W., Hendrix, D, Levine, M & Haley, B. A distinct class of small RNA arising from pri-microRNA sequences in a simple chordate. Nature Structural and Molecular Biology 16, 183 - 189 (2009)

Shi, W.*, Peyrot, S., Munro, E. & Levine, M. FGF3 in the floorplate directs notochord convergent extension in the Ciona tadpole. Development 136, 23-28 (2009)

Shi, W. * & Levine, M. Ephrin signaling establishes asymmetric cell fates in an endomesoderm lineage of the Ciona embryo. Development 135, 931-40 (2008)

Beh, J., Shi, W., Levine, M., Davidson, B. & Christiaen, L. FoxF is essential for FGF-induced migration of heart progenitor cells in the ascidian Ciona intestinalis. Development 134, 3297-305 (2007).

Davidson, B., Shi, W., Beh, J., Christiaen, L. & Levine, M. FGF signaling delineates the cardiac progenitor field in the simple chordate, Ciona intestinalis. Genes Dev 20, 2728-38 (2006).

Shi, W., Levine, M. & Davidson, B. Unraveling genomic regulatory networks in the simple chordate, Ciona intestinalis. Genome Res 15, 1668-74 (2005).

Davidson, B., Shi, W. & Levine, M. Uncoupling heart cell specification and migration in the simple chordate Ciona intestinalis. Development 132, 4811-8 (2005).

Shi, W. Y. & Skeath, J. B. The Drosophila RCC1 homolog, Bj1, regulates

nucleocytoplasmic transport and neural differentiation during Drosophila development. Dev Biol 270, 106-21 (2004).

Alvarez, A. D., Shi, W., Wilson, B. A. & Skeath, J. B. pannier and pointedP2 act sequentially to regulate Drosophila heart development. Development130,3015-26(2003).