上海同济大学 生命科学与技术学院 李 霞（兼职教授）导师简介

姓        名：

 李 霞

 博 士

导师情况：

 博士生导师

研究领域：

研究方向：

 生物信息学、计算系统生物学

     E-mail：

 Lixia6@yahoo.com

联系电话：

 0451-86615922

通讯地址：

 上海市四平路1239号，同济大学生命科学与技术学院（200092）

个人简历：

    李霞，女，教授，博士，博士生导师，龙 江特聘教授，哈尔滨医科大学生物信息学系主任，同济大学兼职教授/博士导师，哈尔滨工业大学计算机科学与技术专业博士毕业。1993年 任副教授，1997年破格晋升为教授，1999年12月到2000年12月受美国UNC与CWRU复杂疾病基因定位奠基人Robert Elston博士邀请，作为访问教授赴美从事复杂疾病基因定位连锁作图和基因表达谱疾病基因发现等研究工作。

    李霞教授主要研究方向是：复杂重大疾病的分子分型与基因定位、计算系统生物学，生物信息融合分析技术、生物动力学、高通量药物有效成分筛选与药物靶发现技术、基因与蛋白质功能研究的生物芯片信息学技术等。在复杂疾病基因识别、生物芯片信息学分析及基因与蛋白质功能预测等研究领域取得了重要的成果。

    李霞教授多年来一直从事生物信息学、数学与计算机及医学应用等方面的教学和科研工作，先后承担课题26项，其中，连年获等国家自然科学基金6项（主持3项，参加（第二）1项，指导2项），国家863高科技计划项目3项（主持1项，副组长1项，参加1项），获省部级奖5项，厅局级奖8项，在国内外重要学术刊物和学术会议上发表学术论文100余篇(SCI 38篇、EI 4篇)，累计影响因子77.234，主编著作等7部。近年来，致力于功能基因的识别方法的研究，科学研究论文发表在国外著名生命科学杂志《 Nucleic Acids Research》 (SCI IF：7.26)、《BIoinformatics》（SCI IF: 6.02）、《BMC Bioinformatics》(SCI IF:5.42)等，论文 “Gene mining: a novel and powerful ensemble decision approach to hunting for disease genes using microarray expression profiling”受到了Nobel奖得主，<>资深编辑Rich Roberts博士的好评，并迅速成为英国牛津出版集团旗舰科学杂志<< Nucleic Acids Research>>的热点文章(Hot Papers)。

     李霞教授领导的哈尔滨医科大学生物信息系在国内率先从事了生物信息学本科生、硕士研究生、博士研究生教育，初步形成了具有良好知识结构生物信息学梯队，为建成国内一流生物信息学学科具有雄厚的后备力量。从2001年开始，已经连续招收了7届生物信息学方向的硕士、博士研究生，生物信息学专业研究生以高质量的培养达到较高水平的毕业标准（撰写出SCI影响因子2.0以上科研论文），目前，培养的硕士研究生发表的科研论文SCI影响因子达到5.48，在研究生培养上取得了国内一流成绩。同时，为上海联合基因公司、天津大学、苏州大学等单位的博士、博士后人员的开展了生物信息学进修培训工作，同哈尔滨工业大学、同济大学等国内一流大学联合培养了多名硕士研究生和博士研究生。为新兴的生物信息学领域的深入研究和人才培养做出了不凡的贡献。

研究领域（具体内容）：

    近几年来， 李霞教授在复杂疾病基因挖掘方面取得了系列研究成果，复杂疾病一般由遗传基因与环境因素共同作用而发生，并且往往有多基互作、遗传异质性等特征，其发病并不能通过一个基因的突变，单一的基因产物或通路的行为来解释。传统的单一基因定位克隆和候选基因关联分析策略已不能全面地阐明人类疾病潜在的遗传复杂性。为此，从SNP标记数据和基因表达谱数据的分析着手，以挖掘复杂疾病基因和研究基因功能为主要目标，对复杂疾病相关基因模式识别方法进行了系统研究，融合模式识别方法、数据挖掘技术和生物信息学领域知识匹配技术，提出创新的基于单核酸（SNP）标记数据和基因表达谱数据分析的系列方法，主要研究内容包括：（1）复杂疾病模式识别理论方法的建立（2）基于单核酸（SNP）标记的同胞对基因连锁分析的模式识别方法研究（3）同胞对方差连锁分析法定位离散型人类复杂疾病基因方法研究（4）集成特征基因挖掘的集成决策方法EFST和EFST的推广方法－基于决策森林特征基因挖掘方法（5）GA和SVM耦合的特征基因挖掘方法GA-SVM研究（6）复杂疾病相关网络的反向构建方法研究，开发有关的生物信息学数据库和分析软件，并应用于信息资源丰富的结肠癌、白血病等疾病的特征基因发现、疾病识别的深度信息挖掘。系列研究成果发表在具有很高影响力和声誉的杂志上（Nucleic Acids Research, 杂志影响因子：7.26)；《BIoinformatics》（SCI IF:6.02）,《BMC Bioinformatics》(SCI IF:5.42)、American Journal of Human Genetics 杂志影响因子11;  Arthritis and Rheumatism,杂志影响因子7.4; Journal of Medical Genetics,杂志影响因子7.7;中国科学;和 Progress in Natural Science等），并获得省政府自然科学2等奖，中华医学奖三等奖等殊荣，在复杂疾病基因作图的模式识别方法研究领域做出重要贡献。

    李霞教授带头主持研制的遗传学群体与家系资料分析系统（PPAP）与遗传优生计算机诊断系统（IDDC）已推广到中国科学院、中国医学科学院／协和医科大学等60多个单位，产生了很好的学术影响，并已成功地应用于10多项国家自然科学基金课题与博士论文的数据信息分析工作(如上海第二医科大学 林海龙博士首次应用PPAP中的受累同胞对方法发现原发性高血压与血管紧张素原基因位点连锁，在该基因区域附近存在高血压易感基因)。PPAP还被成功地应用于北京大学第一医院 吕建军博士小儿失神的基因连锁分析、北京大学 戚豫博士的国家自然科学基金课题家族性热性惊厥的染色单体型相对风险和传递不平衡分析等等.