上海同济大学 生命科学与技术学院 王海芸（副教授）导师简介

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通讯地址：上海市四平路1239号同济大学生命科学与技术学院生物信息学系

个人简介：

     王海芸，女，讲师1998年毕业于中南大学湘雅医学院，获学士学位；2004年毕业于哈尔滨医科大学生物信息学院，获硕士学位；2009年毕业于同济大学生命科学与技术学院，获博士学位2004年于同济大学生命科学与技术学院任职讲师，一直从事生物信息学的科研和教学工作。主要研究方向：人类复杂疾病识别及疾病相关基因和功能通路挖掘；基因表达模式特征及进化研究；基因遗传信息传递特征。

 2004年至今，参加了国家自然科学基金《人类复杂疾病基因表达谱特征基因识别技术》（项目编号：30370798）,并参与2007年重大科学计划项目“微小RNA在若干重要器官发育中的网络调控机理及其功能” （项目编号：2007CB947000）子项目等研究。并在《Bioinformatics》, 《BMC Genomics》,《BMC bioinformatics》, 《Progress in Natural Science》等国际期刊以及ICBBE 2008，ICNC’05-FSKD’05等国际会议录发表论文10多篇。对表达信息在不同物种中传递的充分性，即表达关系与功能关系作了系统分析，发现基因的共表达在不同的物种中其对应的功能的相关性有差异，在人中表达相关的基因功能上不具有相关性，表达信息在传递过程中具有保守性和灵活性，文章发表在《Bioinformatic》和《BMC Genomics》杂志。开发了针对mRNA基因表达谱数据的癌症相关基因的识别程序和疾病预测模型，并应用于大B细胞性淋巴瘤，取得了初步成果，其中申请者开发的疾病相关基因的识别算法“局部特征选择与特征融合技术”，其选择的mRNA生物标记具有很强的生物学意义及多类别的分类能力，相关工作被发表在《Progress in Natural Science》、《BMC bioinformatics》等杂志。目前申请者致力于将医学信息与表达信息和表观遗传信息结合的癌症异质性分析新方法，从而挖掘有临床指导意义的癌症亚型。

专业业绩（承担项目、发表论文、教学成果）：

承担项目：

1.miRNA在心脏和血管发育过程中的调控作用，973重大专项(NO：2000235007)，子项目负责。

2.肾虚证的代谢网络和数学模型研究，国家自然科学基金（NO:30600794），项目组第二合作者。

发表论文：

1．Haiyun Wang, Qi Wang, Bairong Shen and Xia Li. Systematic investigation of global coordination among mRNA and protein in cellular society. BMC Genomics. 　　2010, 11:364.

2．Ganqiang Liu, Min Ding, Haiyun Wang, Jinyan Huang, Qing Jing and Bairong Shen. Pathway analysis of microRNAs in mouse heart development. Int.J.Bioinformatics Research and Applications. 2010,6:12-19.

3．Haiyun Wang, Min Ding, Xia Li, and Bairong Shen. Inferring robust tumor subtypes from the view of clinical evaluation and treatment. The 2nd International Conference on BioMedical Engineering and Informatics. 2009,1859-1862.

4．Haiyun Wang, Qi Wang, Xia Li, Bairong Shen, Min Ding and Ziyin Shen. Towards patterns tree of gene coexpression in eukaryotic species. Bioinformatics,2008， 24(11)：1367-1373.

6．Zheng Guo,Tianwen zhang, Xia Li,Qi Wang,Jianzhen Xu, Hui Yu,Jing Zhu, Haiyun Wang,Chenguang,Eric J Topol,Qing Wang and Shaoqi Rao. Towards precise classification of cancers based on robust gene function expression profiles. BMC bioinformatics.2005;6(1):58-65.

7．Haiyun Wang, Qingpu Zhang, Yadong Wang, Xia Li,Shaoqi Rao,Zuquan Ding, A Novel Feature Ensemble Technology to Improve Prediction Performance of Multiple Heterogeneous Phenotypes Based on Microarray data，In the proceedings of International Conference on Fuzzy Systems and Knowledge Discovery (FSKD05), Chansha, China, August 2005.  LNAI 3614. (Lecture Notes in Artificial Intelligent),  Springer-Verlag.  PP.869-879.

8．王海芸, 李霞，郭政，张瑞杰，四种模式分类方法应用于基因表达谱分析的比较研究.生物医学工程学杂志,2005；22(3)：505-509.

9. 刘伟，丁祖泉，王海芸. 蛋白质结构与功能研究中的分子模拟技术. 上海生物医学工程.　2006；25（1）.

10. 郭政，张田文，王琦，王海芸. 基于功能模块的基因表达谱聚类. 同济大学学报(自然科学版). 2006;36(2).

11. 李丽，李霞，郭政，王海芸. 两种过滤特征基因选择算法的有效性研究. 生命科学研究. 2003；17（4）：369－373.

12. 赵黎明，李霞，郭政，王海芸. 染色体邻近位置基因表达相似性分析及疾病相关基因识别. 哈尔滨医科大学学报. 2003；6（37）：180－183.

教材编写：

1.全国高等学校临床医学专业长学制卫生部规划教材《生物信息学》第七章《基因芯片数据分析》（人民卫生出版社，供8年制及7年制用）

2.生物信息学基础《概率论与信息论基础》编委（哈尔滨出版社）

教学成果：

1．同济大学教学成果一等奖：生命科学与技术创新人才培养模式的探索与实践

2．2007-2008学年度同济大学第二期大学生创新实践训练计划(SITP)二等奖

3．同济大学2007毕业设计(论文)优秀指导教师